A Igreja de São Marcos tem as suas origens numa pequena capela que existia junto à margem do Rio Tejo e cujo Santo padroeiro era o dito São Marcos. No entanto, pela sua localização, esta sofria ciclicamente dos danos causados pelas cheias, de tal modo que não houve alternativa à sua demolição e reedificação noutro local mais protegido da inclemência das águas.
Quando surgiu o imperativo de alargar a estação de Comboios de Santa Apolónia, em Lisboa, foi necessário demolir a igreja de Santa Apolónia, antiga e dotada de belos ornamentos. Ao tomar conhecimento desta situação, o Dr. Ruy Sommer D'Andrade (dono da Quinta do Arripiado), sendo amigo pessoal do Cardeal Patriarca de Lisboa, pediu que a fachada da igreja fosse poupada para ser reconstruída numa nova igreja na sua aldeia natal.
A fachada foi então doada pelo Patriarcado de Lisboa à Comissão de construção da nova igreja, no ano de 1958.
Depois de desmanteladas e catalogadas, as cantarias da fachada foram transportadas por comboio até Tancos, daí seguiram de barco até ao cais de S. Marcos no Arripiado e, finalmente, em carros de bois até ao local de edificação da nova igreja.